Digimon Story: Cyber Sleuth ha molto più della sua giusta dose di battaglie Digimon, quindi dovrai essere in cima al tuo gioco se vuoi essere il migliore. Livellare e acquisire nuove competenze è solo una parte della strategia; dovrai anche Digivolve la tua squadra per ottenere quelle bestie molto ricercate che possono decimare tutte le squadre.
A differenza di un gioco come Pokemon, il tuo Digimon non si limiterà a Digivolve da solo. Quando colpiscono il loro limite di livello, rimangono così fino a quando non fai qualcosa al riguardo. Il processo richiede un approccio pratico, qualcosa che potresti non capire subito. Quando un Digimon raggiunge il livello massimo (o un livello specifico che stavate aspettando) dovete andare su DigiLab.
Interagisci con DigiBank e scegli l'opzione Digivolve / De-digivolve. Ora potrai accedere a tutti i tuoi Digimon e scegliere ciò che vuoi che diventino. Su ciascuna opzione noterai un elenco di requisiti. Gli elementi contrassegnati da un cerchio rosso indicano che li hai incontrati, una "X" blu significa comunque che devi lavorare su quel requisito stat o di livello.
Digivolving riporta il livello di Digimon a 1. Tuttavia, manterrà le sue abilità ereditate e apprenderà nuove abilità speciali, inoltre otterrà un aumento sia dell'attacco base che dei PS. Ora sarai in grado di aumentare di livello il Digimon per colpire la trasformazione successiva o semplicemente per renderla più potente e mantenerla.